یکی از بناهای تاریخی شهر فلاورجان پل تاریخی فلاورجان است. این بنای کمتر شناخته‌ شده روی زاینده‌رود قرار دارد. پل فلاورجان با طول ۱۵۰ متر از پل‌های طولانی اصفهان است. کتیبه نصب شده روی پل نشان می‌دهد که بنا در دوران صفویه ساخته شده است.

روستای اشترجان از توابع فلاورجان است و مسجد جامع فلاورجان نیز با نام همین روستا شناخته می‌شود. ساخت مسجد اشترجان به ۷۰۰ سال پیش بازمی‌گردد. معماری مسجد مربوط به دوره ایلخانی و جزو آثار ملی است.

عمارت چهل برج روستای کلیسان که در نوع خود، یک سازه کمیاب و حتی می توان گفت بدون مشابه است، از ۳۲ برج استوانه ای شکل تو در تو ساخته شده است که در اصطلاح مردم محلی، به چهل برج معروف شده است و با گذر زمان و بارش های فصول پاییز و زمستان، قسمت هایی از آن تخریب شده است.

غار هیکل با عمق ۱۹۰ متر و داشتن چاهی به عمق ۱۷۰ متر در دسته غارهای چاهی قرار داشته و دومین غار از این نوع در ایران است. علت اصلی نامگذاری این غار به نام هیکل، وجود این غار در نزدیکی کوهی به همین نام است. کوه هیکل در فاصله ۵ کیلومتری خوانسار به دلیل اینکه شبیه به پیکر دو سرباز است به این نام مشهور شده‌ است.

امامزاده سیدمحمود (ع) یکی از نوادگان علی النقی (ع) است و در خیابان سیزده محرم شهرستان خوانسار واقع شده‌ است. این بقعه در زمان صفویه بهسازی شده‌ است. قسمت جنوب شرقی این امامزاده سردابی تاریخی ساخته شده از لاشه سنگ و دارای سقف گنبدی شکل کشف شده‌ است که پس از مرمت بهره‌ برداری از آن آغاز شد.

این چشمه آهکی در پارک ملی سرچشمه خوانسار با جوشش آب از حفره‌ها و لابه‌لای سنگ‌ها میزبان گردشگران شهر خوانسار می‌باشد. این چشمه به رودخانه شهر خوانسار می‌پیوندد و از آن ۴۰ لیتر در ثانیه آب برای سیراب کردن زمین‌های کشاورزی و استفاده مردم برداشت می‌شود. چشمه مرزنگشت در دل کوه‌های مشرف بر جنوب غربی خوانسار واقع شده است.

تپه آریایی‌ها، در روستای رحمت‌آباد در فاصله ۳۵ کیلومتری شمال‌شرق خوانسار قرار گرفته است. این تپه از زمان آریایی‌ها به یادگار مانده است و قدمتی حدودا ۸ هزار ساله دارد. گفته می‌شود که این تپه محل زندگی اقوام پیشین بوده است. در گذشته، غارهایی در دل این تپه تاریخی قرار داشته است که از زیر تپه به هم متصل می‌شدند و انسان‌‌ها در آن‌ها زندگی می‌کردند.

امامزاده سید صالح قصیر(ع) از نوادگان موسی کاظم است که در خوانسار واقع شده است. بقعه ایشان در سال ۱۳۵۶ بازسازی شد، همچنین ضریح جدیدی در سال ۱۳۷۷ بر روی سنگ مزار ایشان قرار گرفت. در سال ۱۳۹۴ گنبد جدیدی بر روی این بقعه قرار گرفت.

کوچه باغ های خوانسار یکی از مکان های زیبای این شهر است که می توانید در آن قدم بزنید. خوانسار نماد کامل یک باغ شهر در ایران است. این شهر پر از کوچه باغ‌هایی است که می‌توان در آن‌ها قدم زد. کوچه باغ‌های رویایی خوانسار که با دیوارهای خشتی و درختان سر به فلک کشیده که ارتفاع آن‌ها چندین برابر دیوارها مزین شده‌اند.

خانه حبیبی‌ ها یکی از خانه‌های تاریخی خوانسار است که از گذشته ‌ای پر افتخار خبر می‌دهد. این خانه زیبا با سر در باشکوه و معماری بسیار زیبا و کم‌ نظیرش، توجه هر بیننده یا صاحب ذوق و هنری را به خود جلب می‌کند. هر ساله در ایام محرم، مراسم عزای حسینی در این خانه تاریخی و باشکوه برگزار می‌شود و به همین دلیل این خانه با نام حسینیه حبیبی‌ها میان مردم شهرت دارد.